Depuis 1987, Jean-Michel Gobat est professeur d’écologie générale et de pédologie à l’Université de Neuchâtel (Suisse), où il dirige le laboratoire Sol & Végétation. Après un doctorat sur l’écologie des contacts entre tourbières acides et marais alcalins, il effectue un stage d’écologie numérique à Montpellier (CNRS) et de pédologie biologique à Vandoeuvre-les-Nancy (CNRS). Ceci lui permet d’orienter ses recherches sur la compréhension des relations entre la végétation et les sols, en portant notamment l’accent sur l’évolution de la matière organique et les processus de structuration des sols sous l’influence de la pédofaune. Les travaux récents de son laboratoire, qui intègrent les approches de la phytosociologie, de la biologie des sols et de la pédologie générale, s’appliquent prioritairement aux zones alluviales, aux forêts, ainsi qu’aux marais et tourbières. Avec ses collègues Michel Aragno (Université de Neuchâtel) et Eric Verrecchia (Université de Lausanne), il a mis en place une filière originale de formation, à l’interface de la biologie et de la géologie, le master en biogéosciences. Jean-Michel Gobat a présidé la Société suisse de pédologie de 1996 à 1998.