Depuis 1978, Michel Aragno est professeur de microbiologie générale et de mycologie à l’Université de Neuchâtel, où il dirige le laboratoire de microbiologie. Après un doctorat sur la physiologie d’un champignon parasite de la vigne et des stages de microbiologie du sol à l’Institut Pasteur de Paris et de physiologie bactérienne à l’Université de Göttingen (Basse-Saxe), il oriente ses recherches vers l’écologie et la physiologie bactériennes, notamment celles des bactéries chimiolithoautotrophes et des bactéries fixatrices d’azote. Les milieux les plus étudiés sont les eaux, les sols et les écosystèmes géothermaux. Ses recherches appliquées concernent l’optimisation des processus biologiques de gestion des déchets organiques. Dans le domaine des sols, son laboratoire étudie la biodiversité dans la rhizosphère et la fixation d’azote associative. Les recherches appliquées ont porté en particulier sur le processus biologique du compostage, les phénomènes microbiens associés à la gestion des décharges et la biométhanisation des déchets.