Amel Chaabouni obtient un doctorat en mathématiques à l’Université de Tunis, après des travaux de recherche effectués à l’Université de Genève; elle travaille ensuite comme maître assistante à l’Ecole Nationale d’Ingénieurs de Tunis. Depuis 1996, elle est assistante puis chargée de cours à la section de mathématiques de l’EPFL où elle s’occupe principalement de l’enseignement de l’algèbre linéaire. Nommée au cours de mathématiques spéciales de l’EPFL, elle fait partie du corps enseignant de cette unité depuis août 2008.