Après avoir soutenu sa thèse de doctorat en 1988 au Laboratoire de recherche hydrauliques de l'EPFl, M.S. Altinakar est entré chez Bonnard & Gardel ingénieurs-conseils à Lausanne. Il a conduit plusieurs projets de barrages, d'aménagements hydroélectriques, d'alimentation en eau potable, de protection conte les crues, ainsi que diverses expertises dans le domaine des ouvrages hydrauliques.Dès 1997, M.S. Altinakar réintègre le Laboratoire de recherches hydrauliques de l'EPFL. Ses activités de recherche portent notamment sur les courants de gravité, les écoulements stratifiés, le transport de sédiment et le transport de matière dans les cours d'eau.